本科为A专业，硕士为B专业，欲申请A专业走公派，对方导师会要吗？

我问基委，说只要拿到入学通知书都可以申请，审批标准跟大家一样，没有本科与硕士专业不同就不批的规定。
那么这种情况，我申请国外A专业（PHD）的时候，是否需要跟对方导师讲清楚我的硕士是B专业；为什么是B不是原来的A；如果讲了，他们会同意吗？该怎么办呢？很紧急，关系到这次的研究生要不要报道就读的大事。
A是植物学，B是跟A豪无关系的另外一个专业（调剂的），本科成绩还不错，语言还好，打算还是走A公派。